Анализ результатов, проводимых учеными из BGI (Китайский центр по контролю и профилактике заболеваний), Института микробиологии и эпидемиологии, Академии военных медицинских наук, Университетского медицинского центра Гамбурга, показывают, что эта инфекция вызвана совершенно новым штаммом E. coli.

Ученые сообщают, что они только что получили последовательность генома нового штамма Е. coli. Их результаты показывают, что он несет несколько генов, которые делают его устойчивым к антибиотикам - это мультистойкие и трудно поддающиеся лечению штаммы.

Университетская клиника Гамбург-Эппендорф лечит значительное число инфицированных пациентов из северной Германии. BGI сообщает, что он поддерживает связь и тесно сотрудничает со своими европейскими коллегами. Усилия BGI в настоящее время координируются доктором Liang Yang из Департамента системной биологии Технического университет Дании.

Исследования доктора Yang сосредоточено на патогенезе бактерий, физиологии биопленки, межвидового взаимодействия и микробной эволюции.

Доктор Liang Yang сказал:
«Это захватывающая задача по координации исследований, которые, будем надеяться, помогут остановить эту эпидемию. Мы решили связаться с BGI относительно этого проекта, потому что BGI имеет очень хорошую репутацию в Китае и они сделали большую работу в области секвенирования и анализа вируса атипичной пневмонии за несколько дней во время эпидемии атипичной пневмонии в Азии».

Ученые из BGI говорят, что они используют биоинформативный анализ, а также секвенирование генома, чтобы выявить механизмы патогенеза на уровне целого генома, и это поможет исследователям в борьбе с распространением эпидемии».

Предварительный анализ показывает, что штамм Е. coli является особенно опасным, инвазивным и токсичным, приводящим к кишечным кровотечениям.

Доктор Liang пишет:
 «(По данным исследования) .. эта вспышка штамма EHEC серотипа O104 штамма кишечной палочки и имеет 93% сходства последовательности со штаммом кишечной палочки EAEC 55989, который был выделен в Центральноафриканской Республике».

Этот серотип никогда прежде не вызвал вспышки или эпидемии, добавил Liang.

Согласно анализу последовательности генома, эти бактерии могут вызвать геморрагический колит и гемолитико-уремический синдром у больных.
Штамм EHEC несет гены устойчивости к аминогликозидам, макролидам и бета-лактамным антибиотикам, что серьезно подрывает эффективность лечения антибиотиками. Ученые говорят, что они будут анализировать вирулентность генов далее, а также их лекарственную устойчивость и механизмы переноса генов.

Источник: доктор Liang Yang, BGI

BGI раньше назывался Институтом геномики Китая, является крупнейшей геномной организацией по всему миру. Он был основан в 1999 году.